# gaps_data/conservation/hssp_clustal/1q8j_B_hssp.clustal -- js_divergence - window_size: 0 - window lambda: 0.50 - background: blosum62 - seq. weighting: True - gap penalty: 1 - normalized: False
# reference sequence: 1q8j_B
# align_column_number	score	amino acid
0	M	0.033986	65/1282
1	R	0.019548	132/1282
2	N	0.025322	190/1282
3	R	0.030496	259/1282
4	R	0.039807	362/1282
5	E	0.061499	587/1282
6	V	0.153163	657/1282
7	S	0.056896	665/1282
8	K	0.100729	667/1282
9	L	0.081866	698/1282
10	L	0.137585	716/1282
11	S	0.097619	734/1282
12	E	0.136368	740/1282
13	R	0.156122	741/1282
14	V	0.164791	756/1282
15	L	0.224005	763/1282
16	L	0.212582	769/1282
17	L	0.151129	769/1282
18	D	0.327219	769/1282
19	G	0.319396	769/1282
20	A	0.275283	769/1282
21	Y	0.231056	769/1282
22	G	0.308090	769/1282
23	T	0.301984	769/1282
24	E	0.143058	769/1282
25	F	0.228314	769/1282
26	M	0.214084	768/1282
27	K	0.092288	768/1282
28	Y	0.109895	768/1282
29	G	0.162401	768/1282
30	Y	0.128178	768/1282
31	D	0.108427	769/1282
32	D	0.076648	769/1282
33	L	0.095019	768/1282
34	P	0.181788	768/1282
35	E	0.263064	769/1282
36	E	0.092277	769/1282
37	L	0.238138	769/1282
38	N	0.188513	769/1282
39	I	0.166334	770/1282
40	K	0.179712	771/1282
41	A	0.163894	771/1282
42	P	0.305747	771/1282
43	D	0.207498	771/1282
44	V	0.103845	771/1282
45	V	0.269099	771/1282
46	L	0.077897	771/1282
47	K	0.102649	771/1282
48	V	0.261326	771/1282
49	H	0.331587	771/1282
50	R	0.112728	771/1282
51	S	0.125731	771/1282
52	Y	0.314682	771/1282
53	I	0.182689	771/1282
54	E	0.137342	771/1282
55	S	0.279114	771/1282
56	G	0.342912	771/1282
57	S	0.268454	771/1282
58	D	0.246600	771/1282
59	V	0.207868	771/1282
60	I	0.225173	771/1282
61	L	0.151242	771/1282
62	T	0.305977	771/1282
63	N	0.298306	771/1282
64	T	0.333248	771/1282
65	F	0.347675	771/1282
66	G	0.197751	771/1282
67	A	0.240519	771/1282
68	T	0.250084	771/1282
69	R	0.082922	770/1282
70	M	0.082626	770/1282
71	K	0.153568	771/1282
72	L	0.254167	771/1282
73	R	0.115509	761/1282
74	K	0.115141	762/1282
75	H	0.177035	766/1282
76	G	0.153824	770/1282
77	L	0.119447	769/1282
78	E	0.149060	770/1282
79	D	0.125366	739/1282
80	K	0.091783	737/1282
81	L	0.137824	768/1282
82	D	0.096795	768/1282
83	P	0.172515	769/1282
84	I	0.203298	769/1282
85	V	0.222749	769/1282
86	R	0.076435	768/1282
87	N	0.106227	769/1282
88	A	0.203016	769/1282
89	V	0.192306	767/1282
90	R	0.130514	770/1282
91	I	0.197855	770/1282
92	A	0.249717	770/1282
93	R	0.250366	770/1282
94	R	0.144625	769/1282
95	A	0.186152	770/1282
96	A	0.161364	770/1282
97	G	0.134481	770/1282
98	E	0.128569	770/1282
99	K	0.122141	769/1282
100	L	0.189940	769/1282
101	V	0.281123	769/1282
102	F	0.197863	769/1282
103	G	0.273149	769/1282
104	D	0.187666	769/1282
105	I	0.241054	769/1282
106	G	0.302841	769/1282
107	P	0.293937	769/1282
108	T	0.162076	769/1282
109	G	0.156046	769/1282
110	E	0.104480	769/1282
111	L	0.113130	763/1282
112	P	0.085636	737/1282
113	Y	0.113384	666/1282
114	P	0.098562	745/1282
115	L	0.081866	762/1282
116	G	0.151736	764/1282
117	S	0.088510	765/1282
118	T	0.107384	763/1282
119	L	0.135889	761/1282
120	F	0.162408	761/1282
121	E	0.173721	766/1282
122	E	0.139794	767/1282
123	F	0.158199	766/1282
124	Y	0.121244	745/1282
125	E	0.113575	743/1282
126	N	0.090635	760/1282
127	F	0.262386	758/1282
128	R	0.090265	766/1282
129	E	0.181553	764/1282
130	T	0.197340	765/1282
131	V	0.145838	768/1282
132	E	0.069281	764/1282
133	I	0.130065	766/1282
134	M	0.215659	768/1282
135	V	0.115699	765/1282
136	E	0.156798	768/1282
137	E	0.175641	768/1282
138	G	0.258140	768/1282
139	V	0.202780	768/1282
140	D	0.347608	768/1282
141	G	0.147135	768/1282
142	I	0.225349	768/1282
143	I	0.187224	768/1282
144	F	0.206649	768/1282
145	E	0.355168	768/1282
146	T	0.354543	768/1282
147	F	0.152693	768/1282
148	S	0.151519	767/1282
149	D	0.245474	767/1282
150	I	0.110820	767/1282
151	L	0.122253	768/1282
152	E	0.269820	768/1282
153	L	0.130814	767/1282
154	K	0.206598	767/1282
155	A	0.184250	768/1282
156	A	0.221513	768/1282
157	V	0.173026	765/1282
158	L	0.066360	764/1282
159	A	0.182476	767/1282
160	A	0.141195	768/1282
161	R	0.131608	768/1282
162	E	0.120960	768/1282
163	V	0.061596	738/1282
164	S	0.066474	723/1282
165	R	0.057308	616/1282
166	D	0.082229	760/1282
167	V	0.132797	763/1282
168	F	0.174597	765/1282
169	L	0.180640	766/1282
170	I	0.165346	766/1282
171	A	0.154595	766/1282
172	H	0.144625	765/1282
173	M	0.165078	767/1282
174	T	0.174443	766/1282
175	F	0.144591	766/1282
176	D	0.160038	767/1282
177	E	0.088813	764/1282
178	K	0.087238	765/1282
179	G	0.228177	767/1282
180	R	0.195220	760/1282
181	S	0.196984	760/1282
182	L	0.133287	765/1282
183	T	0.105303	766/1282
184	G	0.297473	766/1282
185	T	0.103776	766/1282
186	D	0.132984	766/1282
187	P	0.130723	766/1282
188	A	0.090401	766/1282
189	N	0.125529	766/1282
190	F	0.164116	766/1282
191	A	0.137844	766/1282
192	I	0.062763	766/1282
193	T	0.094496	766/1282
194	F	0.188463	766/1282
195	D	0.105885	766/1282
196	E	0.119509	766/1282
197	L	0.092154	765/1282
198	D	0.136704	766/1282
199	I	0.170978	766/1282
200	D	0.119312	766/1282
201	A	0.149102	766/1282
202	L	0.199074	766/1282
203	G	0.321393	766/1282
204	I	0.176174	766/1282
205	N	0.369400	766/1282
206	C	0.382647	765/1282
207	S	0.175144	764/1282
208	L	0.124206	743/1282
209	G	0.282534	765/1282
210	P	0.258138	765/1282
211	E	0.090724	764/1282
212	E	0.106566	764/1282
213	I	0.238854	764/1282
214	L	0.090164	764/1282
215	P	0.133612	765/1282
216	I	0.122434	765/1282
217	F	0.196909	765/1282
218	Q	0.117918	765/1282
219	E	0.071407	765/1282
220	L	0.213934	765/1282
221	S	0.103299	764/1282
222	Q	0.058675	763/1282
223	Y	0.046790	761/1282
224	T	0.129797	764/1282
225	D	0.106237	763/1282
226	K	0.056646	764/1282
227	F	0.182908	764/1282
228	L	0.220779	764/1282
229	V	0.169904	764/1282
230	V	0.192492	764/1282
231	E	0.180108	763/1282
232	P	0.290492	762/1282
233	N	0.351079	760/1282
234	A	0.262655	759/1282
235	G	0.301732	707/1282
236	Y	0.241701	283/1282
237	P	0.142034	284/1282
238	L	0.089712	286/1282
239	K	0.095373	286/1282
240	P	0.201359	287/1282
241	H	0.092944	289/1282
242	D	0.084262	289/1282
243	F	0.178459	289/1282
244	A	0.122207	289/1282
245	V	0.054750	288/1282
246	H	0.066663	287/1282
247	I	0.077550	287/1282
248	D	0.051808	287/1282
249	S	0.048015	287/1282
250	Y	0.144733	287/1282
251	Y	0.088031	288/1282
252	E	0.117664	289/1282
253	L	0.039650	289/1282
254	G	0.191202	289/1282
255	V	0.155410	303/1282
256	N	0.123808	303/1282
257	I	0.144751	303/1282
258	F	0.143269	303/1282
259	G	0.231666	303/1282
260	G	0.232826	303/1282
261	C	0.279197	303/1282
262	C	0.273792	303/1282
263	G	0.239934	303/1282
264	T	0.234989	304/1282
265	T	0.174700	304/1282
266	P	0.241578	304/1282
267	E	0.121662	304/1282
268	H	0.242984	304/1282
269	V	0.198301	304/1282
270	K	0.117853	304/1282
271	L	0.087916	305/1282
272	F	0.131040	305/1282
273	R	0.091520	305/1282
274	K	0.095900	305/1282
275	V	0.069389	304/1282
276	L	0.115784	303/1282
277	G	0.071170	303/1282
278	N	0.060464	301/1282
279	R	0.056844	303/1282
280	K	0.084410	302/1282
281	P	0.136521	300/1282
282	L	0.081816	288/1282
283	Q	0.049714	285/1282
284	R	0.071487	284/1282
285	K	0.061411	282/1282
286	K	0.060887	283/1282
287	K	0.052319	305/1282
288	R	0.032494	298/1282
289	I	0.043384	302/1282
290	F	0.033155	300/1282
291	A	0.042931	302/1282
292	V	0.057283	302/1282
293	S	0.092084	302/1282
294	S	0.141371	302/1282
295	P	0.055586	302/1282
296	S	0.070975	302/1282
297	K	0.043242	302/1282
298	L	0.058896	301/1282
299	V	0.049619	302/1282
300	T	0.029025	302/1282
301	F	0.057619	303/1282
302	D	0.078358	304/1282
303	H	0.061740	301/1282
304	F	0.149260	313/1282
305	V	0.096248	313/1282
306	V	0.121648	316/1282
307	I	0.200894	316/1282
308	G	0.256021	318/1282
309	E	0.269703	318/1282
310	R	0.252642	319/1282
311	I	0.157896	319/1282
312	N	0.262677	319/1282
313	P	0.143124	312/1282
314	A	0.137024	319/1282
315	G	0.208063	318/1282
316	R	0.180617	316/1282
317	K	0.165915	313/1282
318	K	0.125395	315/1282
319	L	0.161546	311/1282
320	W	0.104916	307/1282
321	A	0.125924	307/1282
322	E	0.136438	305/1282
323	M	0.168907	307/1282
324	Q	0.084938	307/1282
325	K	0.121609	307/1282
326	G	0.125127	307/1282
327	N	0.152653	307/1282
328	E	0.119995	307/1282
329	E	0.133453	306/1282
330	I	0.058767	305/1282
331	V	0.124882	305/1282
332	I	0.095804	303/1282
333	K	0.083016	304/1282
334	E	0.116370	304/1282
335	A	0.208955	304/1282
336	K	0.122421	303/1282
337	T	0.093112	303/1282
338	Q	0.275754	303/1282
339	V	0.131264	303/1282
340	E	0.130173	303/1282
341	K	0.089995	303/1282
342	G	0.234751	303/1282
343	A	0.226531	303/1282
344	E	0.140905	303/1282
345	V	0.148093	303/1282
346	L	0.210857	303/1282
347	D	0.266836	303/1282
348	V	0.199215	303/1282
349	N	0.261302	303/1282
350	F	0.148485	303/1282
351	G	0.197303	302/1282
352	I	0.063803	298/1282
353	E	0.107166	302/1282
354	S	0.092324	302/1282
355	Q	0.079561	302/1282
356	I	0.108406	302/1282
357	D	0.117546	302/1282
358	V	0.094973	302/1282
359	R	0.078438	302/1282
360	Y	0.065934	302/1282
361	V	0.200518	302/1282
362	E	0.061319	302/1282
363	K	0.143935	302/1282
364	I	0.122915	302/1282
365	V	0.156490	302/1282
366	Q	0.052634	302/1282
367	T	0.051807	302/1282
368	L	0.128443	302/1282
369	P	0.125822	302/1282
370	Y	0.063777	302/1282
371	V	0.085684	302/1282
372	S	0.100382	302/1282
373	N	0.094607	302/1282
374	V	0.146211	303/1282
375	P	0.269448	303/1282
376	L	0.182603	303/1282
377	S	0.194659	303/1282
378	L	0.195504	303/1282
379	D	0.282470	303/1282
380	I	0.228249	303/1282
381	Q	0.180930	303/1282
382	N	0.118465	303/1282
383	V	0.104598	303/1282
384	D	0.093377	303/1282
385	L	0.148766	303/1282
386	T	0.177676	303/1282
387	E	0.229991	303/1282
388	R	0.107572	303/1282
389	A	0.206920	303/1282
390	L	0.204055	303/1282
391	R	0.151771	303/1282
392	A	0.089879	303/1282
393	Y	0.125802	303/1282
394	P	0.115244	303/1282
395	G	0.241173	303/1282
396	R	0.205836	303/1282
397	S	0.154206	303/1282
398	L	0.190341	303/1282
399	F	0.186448	303/1282
400	N	0.290671	303/1282
401	S	0.277535	303/1282
402	A	0.173416	303/1282
403	K	0.180302	300/1282
404	V	0.118176	300/1282
405	D	0.173647	303/1282
406	E	0.146538	303/1282
407	E	0.143485	303/1282
408	E	0.094643	303/1282
409	L	0.090560	303/1282
410	E	0.099616	303/1282
411	M	0.071946	303/1282
412	K	0.104291	303/1282
413	I	0.115849	303/1282
414	N	0.134557	303/1282
415	L	0.170013	303/1282
416	L	0.141841	303/1282
417	K	0.153825	303/1282
418	K	0.157535	303/1282
419	Y	0.258408	303/1282
420	G	0.210968	303/1282
421	G	0.175825	303/1282
422	T	0.112792	303/1282
423	L	0.143801	303/1282
424	I	0.220734	303/1282
425	V	0.143318	303/1282
426	L	0.202339	268/1282
427	L	0.015588	8/1282
428	S	0.026865	38/1282
429	F	0.018189	38/1282
430	E	0.051493	112/1282
431	E	0.045415	118/1282
432	R	0.048175	118/1282
433	K	0.019476	121/1282
434	E	0.034718	121/1282
435	Y	0.040589	121/1282
436	F	0.048178	121/1282
437	E	0.039823	121/1282
438	K	0.038692	121/1282
439	A	0.043877	121/1282
440	L	0.025922	121/1282
441	K	0.042805	122/1282
442	I	0.048583	122/1282
443	L	0.040910	123/1282
444	E	0.032429	123/1282
445	R	0.039896	123/1282
446	H	0.025286	123/1282
447	D	0.024002	121/1282
448	F	0.024056	118/1282
449	S	0.030761	120/1282
450	D	0.044030	123/1282
451	R	0.078074	123/1282
452	V	0.074454	126/1282
453	I	0.061074	126/1282
454	F	0.073607	126/1282
455	D	0.102813	126/1282
456	P	0.083529	126/1282
457	G	0.063314	126/1282
458	V	0.059247	126/1282
459	L	0.058535	126/1282
460	P	0.066938	126/1282
461	L	0.055306	126/1282
462	G	0.060543	111/1282
463	A	0.059788	126/1282
464	E	0.032530	120/1282
465	G	0.045365	126/1282
466	K	0.034480	126/1282
467	P	0.038383	126/1282
468	V	0.032241	126/1282
469	E	0.048703	126/1282
470	V	0.039984	126/1282
471	L	0.055022	126/1282
472	K	0.051998	125/1282
473	T	0.044113	126/1282
474	I	0.070457	126/1282
475	E	0.041498	126/1282
476	F	0.039872	125/1282
477	I	0.056078	125/1282
478	S	0.035687	126/1282
479	S	0.042097	122/1282
480	K	0.040009	126/1282
481	G	0.055595	126/1282
482	F	0.045787	126/1282
483	N	0.052737	126/1282
484	T	0.062032	126/1282
485	T	0.060131	126/1282
486	V	0.052977	126/1282
487	G	0.098611	126/1282
488	L	0.061860	126/1282
489	S	0.104489	126/1282
490	N	0.103766	126/1282
491	L	0.056670	126/1282
492	S	0.089200	126/1282
493	P	0.064945	25/1282
494	D	0.033243	25/1282
495	R	0.073568	26/1282
496	S	0.031367	26/1282
497	Y	0.034739	26/1282
498	Y	0.046636	26/1282
499	N	0.071239	26/1282
500	T	0.041624	26/1282
501	A	0.051671	26/1282
502	F	0.071184	26/1282
503	L	0.063820	26/1282
504	V	0.043189	26/1282
505	L	0.055933	26/1282
506	G	0.057622	26/1282
507	I	0.045224	26/1282
508	S	0.030237	26/1282
509	K	0.039225	26/1282
510	G	0.068043	26/1282
511	L	0.054689	26/1282
512	S	0.046722	26/1282
513	S	0.043195	26/1282
514	A	0.060946	26/1282
515	I	0.071565	26/1282
516	M	0.045932	26/1282
517	N	0.067736	26/1282
518	P	0.069454	26/1282
519	L	0.032424	26/1282
520	D	0.047416	26/1282
521	E	0.033576	26/1282
522	T	0.028311	26/1282
523	L	0.053609	26/1282
524	M	0.065468	26/1282
525	K	0.039926	26/1282
526	T	0.033429	26/1282
527	L	0.040425	26/1282
528	N	0.039684	26/1282
529	A	0.055266	26/1282
530	T	0.031738	26/1282
531	L	0.031875	26/1282
532	V	0.036631	26/1282
533	I	0.054582	26/1282
534	L	0.038858	24/1282
535	E	0.034232	24/1282
536	K	0.049927	23/1282
537	K	0.015734	6/1282