# gaps_data/conservation/hssp_clustal/1p77_A_hssp.clustal -- js_divergence - window_size: 0 - window lambda: 0.50 - background: blosum62 - seq. weighting: True - gap penalty: 1 - normalized: False # reference sequence: 1p77_A # align_column_number score amino acid 0 M 0.139960 306/1431 1 D 0.118201 472/1431 2 L 0.164362 612/1431 3 Y 0.293535 652/1431 4 A 0.266756 671/1431 5 V 0.373659 731/1431 6 W 0.300930 731/1431 7 G 0.484533 732/1431 8 N 0.256518 732/1431 9 P 0.442989 732/1431 10 I 0.359628 732/1431 11 A 0.166629 732/1431 12 Q 0.421372 735/1431 13 S 0.488430 769/1431 14 K 0.262628 769/1431 15 S 0.486061 769/1431 16 P 0.541962 769/1431 17 L 0.114645 769/1431 18 I 0.393781 769/1431 19 Q 0.477105 769/1431 20 N 0.224933 767/1431 21 K 0.094963 740/1431 22 L 0.234938 735/1431 23 A 0.275383 758/1431 24 A 0.184594 767/1431 25 Q 0.154934 766/1431 26 T 0.151256 765/1431 27 H 0.263942 769/1431 28 Q 0.217852 771/1431 29 T 0.141483 778/1431 30 M 0.152882 780/1431 31 E 0.064505 796/1431 32 Y 0.508884 796/1431 33 I 0.088087 794/1431 34 A 0.219050 794/1431 35 K 0.149281 788/1431 36 L 0.118199 782/1431 37 G 0.179350 781/1431 38 D 0.195621 786/1431 39 L 0.117244 789/1431 40 D 0.214209 795/1431 41 A 0.145428 795/1431 42 F 0.313866 795/1431 43 E 0.097409 795/1431 44 Q 0.104020 794/1431 45 Q 0.109146 794/1431 46 L 0.243290 784/1431 47 L 0.099970 780/1431 48 A 0.119822 782/1431 49 F 0.292765 793/1431 50 F 0.165468 787/1431 51 E 0.122700 792/1431 52 E 0.072754 792/1431 53 G 0.275472 795/1431 54 A 0.182632 775/1431 55 K 0.107609 796/1431 56 G 0.531434 796/1431 57 C 0.249768 796/1431 58 N 0.489436 797/1431 59 I 0.425175 798/1431 60 T 0.548228 798/1431 61 S 0.268184 798/1431 62 P 0.605640 800/1431 63 F 0.466713 800/1431 64 K 0.591901 800/1431 65 E 0.264755 800/1431 66 R 0.165233 800/1431 67 A 0.369935 803/1431 68 Y 0.288262 807/1431 69 Q 0.174116 807/1431 70 L 0.249088 807/1431 71 A 0.310436 807/1431 72 D 0.383699 816/1431 73 E 0.145593 816/1431 74 Y 0.206931 805/1431 75 S 0.314819 816/1431 76 Q 0.235805 813/1431 77 R 0.128406 816/1431 78 A 0.476294 816/1431 79 K 0.174856 816/1431 80 L 0.128523 850/1431 81 A 0.307868 862/1431 82 E 0.407007 862/1431 83 A 0.478822 865/1431 84 C 0.415480 865/1431 85 N 0.597784 866/1431 86 T 0.480327 868/1431 87 L 0.383649 871/1431 88 K 0.183750 870/1431 89 K 0.143189 596/1431 90 L 0.075853 719/1431 91 D 0.187812 860/1431 92 D 0.305087 877/1431 93 G 0.361823 877/1431 94 K 0.192295 868/1431 95 L 0.302228 877/1431 96 Y 0.179834 875/1431 97 A 0.463088 875/1431 98 D 0.316691 874/1431 99 N 0.560773 878/1431 100 T 0.528047 878/1431 101 D 0.607165 878/1431 102 G 0.325334 877/1431 103 I 0.107111 908/1431 104 G 0.526440 908/1431 105 L 0.375389 908/1431 106 V 0.184198 908/1431 107 T 0.154016 908/1431 108 D 0.235134 908/1431 109 L 0.406850 908/1431 110 Q 0.131069 906/1431 111 R 0.156826 905/1431 112 L 0.088381 902/1431 113 N 0.107348 901/1431 114 W 0.074962 890/1431 115 L 0.056559 867/1431 116 R 0.088843 841/1431 117 P 0.125205 876/1431 118 N 0.165588 878/1431 119 Q 0.162463 902/1431 120 H 0.189734 904/1431 121 V 0.312106 905/1431 122 L 0.305817 906/1431 123 I 0.373487 906/1431 124 L 0.328321 906/1431 125 G 0.565984 906/1431 126 A 0.457680 906/1431 127 G 0.545338 906/1431 128 G 0.565984 906/1431 129 A 0.422985 906/1431 130 T 0.344832 906/1431 131 K 0.328908 906/1431 132 G 0.406688 906/1431 133 V 0.353672 906/1431 134 L 0.247726 905/1431 135 L 0.106871 905/1431 136 P 0.215837 905/1431 137 L 0.374565 905/1431 138 L 0.171946 905/1431 139 Q 0.156343 904/1431 140 A 0.091614 902/1431 141 Q 0.157906 903/1431 142 Q 0.082764 899/1431 143 N 0.146518 905/1431 144 I 0.307622 905/1431 145 V 0.151610 905/1431 146 L 0.369134 905/1431 147 A 0.190413 905/1431 148 N 0.408341 906/1431 149 R 0.451854 906/1431 150 T 0.364718 905/1431 151 F 0.071945 883/1431 152 S 0.166498 885/1431 153 K 0.331017 886/1431 154 T 0.286259 870/1431 155 K 0.160332 869/1431 156 E 0.127614 869/1431 157 L 0.324131 869/1431 158 A 0.174843 884/1431 159 E 0.162597 875/1431 160 R 0.071788 874/1431 161 F 0.242682 875/1431 162 Q 0.102836 874/1431 163 P 0.076118 799/1431 164 Y 0.041528 793/1431 165 G 0.081721 793/1431 166 N 0.063114 805/1431 167 I 0.115776 874/1431 168 Q 0.051683 879/1431 169 A 0.109760 885/1431 170 V 0.076750 880/1431 171 S 0.078107 882/1431 172 M 0.077767 874/1431 173 D 0.087788 861/1431 174 S 0.073787 861/1431 175 I 0.068192 846/1431 176 P 0.074905 778/1431 177 L 0.086113 805/1431 178 Q 0.095281 887/1431 179 T 0.110797 886/1431 180 Y 0.240253 890/1431 181 D 0.338860 894/1431 182 L 0.323684 896/1431 183 V 0.367245 905/1431 184 I 0.447475 905/1431 185 N 0.536391 901/1431 186 A 0.340433 898/1431 187 T 0.505769 896/1431 188 S 0.326807 798/1431 189 A 0.185198 418/1431 190 S 0.051799 229/1431 191 V 0.096562 411/1431 192 D 0.103436 469/1431 193 A 0.035534 484/1431 194 E 0.048516 487/1431 195 I 0.058681 493/1431 196 L 0.105055 506/1431 197 K 0.050148 507/1431 198 L 0.038885 505/1431 199 G 0.041523 507/1431 200 S 0.039298 505/1431 201 A 0.055356 507/1431 202 F 0.107420 505/1431 203 Y 0.141040 519/1431 204 D 0.218561 523/1431 205 M 0.159064 523/1431 206 Q 0.096740 523/1431 207 Y 0.217729 523/1431 208 A 0.070151 523/1431 209 K 0.104844 522/1431 210 G 0.049780 405/1431 211 T 0.042369 180/1431 212 D 0.036666 489/1431 213 T 0.174203 523/1431 214 P 0.083472 523/1431 215 F 0.192655 523/1431 216 I 0.121854 523/1431 217 A 0.071844 523/1431 218 L 0.082011 523/1431 219 C 0.155035 523/1431 220 K 0.088936 523/1431 221 S 0.073793 522/1431 222 L 0.062465 522/1431 223 G 0.158512 523/1431 224 L 0.084432 523/1431 225 T 0.046116 481/1431 226 N 0.042819 365/1431 227 V 0.092288 509/1431 228 S 0.071489 523/1431 229 D 0.173426 523/1431 230 G 0.218793 523/1431 231 F 0.134748 523/1431 232 G 0.141124 523/1431 233 M 0.228558 523/1431 234 L 0.198342 523/1431 235 V 0.151505 523/1431 236 A 0.097248 523/1431 237 Q 0.234504 523/1431 238 A 0.179834 523/1431 239 A 0.128353 523/1431 240 H 0.065713 523/1431 241 S 0.143501 523/1431 242 F 0.186879 523/1431 243 H 0.060668 523/1431 244 L 0.102203 523/1431 245 W 0.238010 522/1431 246 R 0.130036 521/1431 247 G 0.167369 519/1431 248 V 0.062460 513/1431 249 M 0.066858 500/1431 250 P 0.163523 500/1431 251 D 0.086428 498/1431 252 F 0.057578 459/1431 253 V 0.040030 452/1431 254 S 0.045815 452/1431 255 V 0.105891 478/1431 256 Y 0.060883 485/1431 257 E 0.069013 494/1431 258 Q 0.052259 492/1431 259 L 0.116516 486/1431 260 K 0.086611 485/1431 261 K 0.046018 409/1431 262 A 0.041112 392/1431 263 M 0.076284 378/1431 264 L 0.049630 113/1431